土地增值税清算-申报收入与网签信息不一致，甲供成本重复扣除

某房地产开发企业，总建筑面积12950.01㎡，其中普通住宅11536.54㎡，地下室518㎡，地下车库895.47㎡，开发商与施工方签订的施工合同内容是包工包料，项目主要建设期2008年9月-2009年10月，合同金额为18,845,096.00元，销售比例100%。

解析：

1、  根据企业申报信息，普通住宅收入32,209,957.00元，地下室、车库收入1,974,400.00元，合计收入34,184,400.00元，根据当地商品房网上备案系统该项目，签约套数，签约面积都准确，签约价值34,733,236.95元，与企业申报收入不一致，相差548,879.95元，土地增值税清算时该部分收入应调增，并交纳相应的营业税金及附加，企业所得税调整应纳税所得额，如果税务机关在稽查时发现该问题，补缴这部分税款时会有滞纳金和罚款。

2、  开发商与施工方签订的施工合同时包工包料，但是企业申报的成本中，出现了大量的甲供材信息，与企业沟通后，企业解释，签订合同时是包工包料，但施工过程中施工方资金链断裂，故有些材料有甲方来购买。施工过程中，施工方资金断裂有可能，但是房地产企业申报的成本中，施工方的开票金额仍然是18,845,096.00元，购买螺纹、商品砼等材料的金额3,862,271. 00元，并没有在合同金额中扣除，造成该甲供材部分的成本在成本核算时重复扣除，在土地增值税清算及企业所得税汇算清缴时，该部分成本都应该调减。